Grundeinstellungen
Überschreiben von Remote Dateien prüfen
Damit Dateien auf Servern nicht durch evtl. eingestellte Auto-Deployment-Einstellungen überschrieben werden, muss global in PHPStorm konfiguriert werden, dass Änderungen an Remote-Dateien vor dem Upload geprüft werden.
Menu: File -> Default Settings
In den Default Einstellungen dann: Build, Execution, Deployment -> Deployment -> Options und dort wie nachfolgend aufgezeigt konfigurieren:



